El río Cisnes se forma en Los Andes limítrofes de la unión de varios arroyos y coincide con el límite con Argentina, llamada divisoria de aguas. Recorre 160 kilómetros hasta su desembocadura en la bahía de Puerto Cisnes, en el canal Puyuhuapi. Sus aguas forman rápidos, saltos y tienen rocas provenientes de derrumbes. Algunos de sus caudalosos afluentes son el río Moro y el río Grande, y 5 km antes de se le une el río Picacho. En su curso superior se encuentra la localidad de La Tapera, y la Estancia Río Cisnes, luego acoge las aguas del lago Las Torres. Desde la carretera podrás observarlo con toda su potencia en el sector Piedra del Gato.


Este río es navegable en sus últimos 12 kilómetros antes de su desembocadura. En general, su clima es de estepa, por lo que no es lluvioso, y corren fuertes vientos provenientes de la pampa argentina.